主角有马拓也为一个无所事事的高中生，他父亲是历史学家，却在研究时失踪，留下他与继母两人相依为命。暑假时主角收到父亲寄来的包裹，里面有一个罗盘和三颗水晶珠，以及一封写着「时间是可逆的，历史是不可逆的」云云以及一些关于平行世界概念的信，并交待主角晚上去当地有名的地标剑之岬去见一个人。　　拓也晚上如约来到剑之岬，发现自己的继母亚由美和父亲研究夥伴龙藏寺幸三都在场。原本和蔼的龙藏寺突然翻脸要有马把收到的邮...

互いへの想いを通じ合わせた涼と颯馬は、ついに恋人同士に。　　心もカラダもより深く繋がってラブラブな日々…と思いきや、涼の職場に元カレ・玲が現れて！？　　3人の頭をよぎる、すれ違った学生時代の記憶。　　関わるまいとする涼だが、玲とチームを組むことになってしまい――...